Program Magister Manajemen Unissula berada di bawah naungan Fakultas Ekonomi Universitas Islam Sultan Agung Semarang. Program ini mulai berdiri pada tahun 2001 (SK Dikti Nomor : 2613/D/T/2001) pada tanggal 8 Juni 2001, dengan Pengelola :
Ketua : Dr. Moch. Zulfa, SE., MM
Sekretaris : Prof. Dr. Wuryanti, SE., MM
Joko Bomber Setyo Utomo, SE., MM
Dan kemudian ada perpanjangan ijin operasional pada tahun 2010 (Nomor SK Ijin Operasional: 1310/D/T/K-VI/2010).
Pada tahun 2006 program studi MM Unissula mendapatkan Akreditasi dari BAN PT dengan Peringkat “B” (SK BAN-PT Nomor: 00553/Ak-V/S2-001/UIGMMJ/V/2006), yang kemudian pada tahun 2012 mendapatkan Akreditasi “A” (SK BAN-PT Nomor: 010/BAN-PT/Ak-X/S2/VII/2012). Lalu pada tahun 2021 hingga sekarang program studi MM Unissula berhasil meraih Akreditasi Unggul oleh BAN PT (SK BAN-PT Nomor: 13166/SK/BAN-PT/AK/ISK/M/XII/2021)
Para Pengelola Program Magister Manajemen
| Tahun | Ketua Program Studi | Sekretaris Program Studi |
| 2005 – 2009 | Prof. Dr. Ibnu Khajar, SE., M.Si | Dr. Asyhari, SE., M.Si |
| Dr. Sahid Sumarno, SE., M.Si | ||
| 2009 – 2013 | Dr. Mutamimah, SE., M.Si | Prof. Dr. Heru Sulistyo, SE., M.Si |
| 2013 – 2017 | Widiyanto, SE., M.Si., Ph.D | Prof. Dr. Widodo, SE., M.Si |
| Prof. Dr. Nunung Ghoniyah, SE., M.Si | ||
| 2017 – 2021 | Prof. Dr. Widodo, SE., M.Si | Prof. Dr. Nunung Ghoniyah, SE., M.Si |
| 2021 – 2026 | Prof. Dr. Heru Sulistyo, SE., M.Si | Nurhidayati, SE., M.Si., Ph.D |
| Prof. Dr. Ibnu Khajar, SE., M.Si |